Protein–RNA interactions for Protein: A6NCQ9

RNF222, RING finger protein 222, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF222A6NCQ9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RNF222A6NCQ9 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms