Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.29■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LRRD1A4D1F6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LRRD1A4D1F6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms