Protein–RNA interactions for Protein: A2RTX5

TARSL2, Probable threonine--tRNA ligase 2, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARSL2A2RTX5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TARSL2A2RTX5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TARSL2A2RTX5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms