Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
V9GYQ6 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
V9GYQ6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
V9GYQ6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
V9GYQ6 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
V9GYQ6 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
V9GYQ6 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
V9GYQ6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
V9GYQ6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
V9GYQ6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
V9GYQ6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
V9GYQ6 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
V9GYQ6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
V9GYQ6 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
V9GYQ6 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
V9GYQ6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
V9GYQ6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
V9GYQ6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
V9GYQ6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
V9GYQ6 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
V9GYQ6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
V9GYQ6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
V9GYQ6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
V9GYQ6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
V9GYQ6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
V9GYQ6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
V9GYQ6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
V9GYQ6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
V9GYQ6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
V9GYQ6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
V9GYQ6 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
V9GYQ6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
V9GYQ6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
V9GYQ6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
V9GYQ6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
V9GYQ6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
V9GYQ6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
V9GYQ6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
V9GYQ6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
V9GYQ6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
V9GYQ6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
V9GYQ6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
V9GYQ6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
V9GYQ6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
V9GYQ6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
V9GYQ6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
V9GYQ6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
V9GYQ6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
V9GYQ6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
V9GYQ6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
V9GYQ6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
V9GYQ6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
V9GYQ6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
V9GYQ6 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
V9GYQ6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
V9GYQ6 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
V9GYQ6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYQ6 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYQ6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYQ6 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYQ6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYQ6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYQ6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYQ6 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYQ6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYQ6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYQ6 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYQ6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYQ6 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYQ6 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYQ6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYQ6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYQ6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYQ6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYQ6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYQ6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYQ6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYQ6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYQ6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYQ6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
V9GYQ6 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
V9GYQ6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
V9GYQ6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
V9GYQ6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
V9GYQ6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
V9GYQ6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
V9GYQ6 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
V9GYQ6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
V9GYQ6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
V9GYQ6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
V9GYQ6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
V9GYQ6 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
V9GYQ6 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
V9GYQ6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
V9GYQ6 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
V9GYQ6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
V9GYQ6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
V9GYQ6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
V9GYQ6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
V9GYQ6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms