Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
SNX13Q9Y5W8 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
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SNX13Q9Y5W8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SNX13Q9Y5W8 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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