Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J7

TIMM9, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim9, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM9Q9Y5J7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
TIMM9Q9Y5J7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TIMM9Q9Y5J7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms