Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
KLF12Q9Y4X4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms