Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SH3BP1Q9Y3L3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SH3BP1Q9Y3L3 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms