Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.77■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Q9Y3F1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms