Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PACSIN3Q9UKS6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PACSIN3Q9UKS6 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms