Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
FAM8A1Q9UBU6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms