Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCHIP1Q9P0W5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCHIP1Q9P0W5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms