Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
ARHGEF12Q9NZN5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
ARHGEF12Q9NZN5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ARHGEF12Q9NZN5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ARHGEF12Q9NZN5 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ARHGEF12Q9NZN5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
ARHGEF12Q9NZN5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARHGEF12Q9NZN5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARHGEF12Q9NZN5 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARHGEF12Q9NZN5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARHGEF12Q9NZN5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARHGEF12Q9NZN5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARHGEF12Q9NZN5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARHGEF12Q9NZN5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARHGEF12Q9NZN5 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ARHGEF12Q9NZN5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms