Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRMT13Q9NUP7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms