Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
LMBRD1Q9NUN5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
LMBRD1Q9NUN5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms