Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PKDREJQ9NTG1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PKDREJQ9NTG1 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms