Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
BATF3Q9NR55 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
BATF3Q9NR55 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms