Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLCO1B3Q9NPD5 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLCO1B3Q9NPD5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms