Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ3

DNAJC4, DnaJ homolog subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC4Q9NNZ3 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DNAJC4Q9NNZ3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms