Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDCL3Q9H2J4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDCL3Q9H2J4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms