Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CTDSP1Q9GZU7 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms