Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
INO80BQ9C086 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
INO80BQ9C086 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms