Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL8

CDCA4, Cell division cycle-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA4Q9BXL8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CDCA4Q9BXL8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDCA4Q9BXL8 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms