Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CRACR2AQ9BSW2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CRACR2AQ9BSW2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms