Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NIPSNAP3BQ9BS92 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms