Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRD0

BUD13, BUD13 homolog, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BUD13Q9BRD0 ATG7-217ENST00000460444 540 ntTSL 411.56□□□□□ -0.562e-6■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 TBCK-202ENST00000361687 3312 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.742e-8■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 AP1G2-219ENST00000555789 318 ntTSL 310.28□□□□□ -0.763e-10■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 AP1G2-215ENST00000554977 569 ntTSL 49.88□□□□□ -0.834e-10■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 TBCK-203ENST00000394706 3349 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.832e-8■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 RPL7L1-205ENST00000483998 1103 ntTSL 59.61□□□□□ -0.872e-6■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 TSC22D1-201ENST00000261489 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.915e-7■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 TBCK-201ENST00000273980 8101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.924e-8■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 TBCK-206ENST00000467183 3566 ntTSL 1 (best)9.25□□□□□ -0.932e-8■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 AP1G2-221ENST00000555974 349 ntTSL 39.16□□□□□ -0.943e-10■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 TSC22D1-213ENST00000622051 2872 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.995e-7■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 TSC22D1-212ENST00000611198 2877 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.995e-7■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 RPL7L1-208ENST00000493763 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -12e-6■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 CHD1-209ENST00000512844 848 ntTSL 58.56□□□□□ -1.042e-6■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 ATG7-210ENST00000435760 647 ntTSL 48.09□□□□□ -1.112e-6■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 CHD1-208ENST00000512392 1968 ntTSL 28.03□□□□□ -1.122e-6■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 TTI1-206ENST00000620381 432 nt8.02□□□□□ -1.138e-10■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 ATG7-204ENST00000418682 584 ntTSL 57.66□□□□□ -1.182e-6■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 RPL7L1-201ENST00000304734 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.222e-6■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 RPL7L1-210ENST00000602561 703 ntTSL 27.4□□□□□ -1.222e-6■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 TBCK-217ENST00000510927 2826 ntTSL 27.1□□□□□ -1.275e-8■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 RPL7L1-204ENST00000462348 702 ntTSL 36.86□□□□□ -1.312e-6■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 TBCK-214ENST00000508666 897 ntTSL 56.81□□□□□ -1.322e-6■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 TSC22D1-210ENST00000496838 551 ntTSL 1 (best)6.78□□□□□ -1.325e-7■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 CHD1-203ENST00000505657 736 ntTSL 36.31□□□□□ -1.42e-6■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.422e-8■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 CEP83-210ENST00000550328 241 ntTSL 56.07□□□□□ -1.442e-6■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 CEP83-209ENST00000549352 861 ntTSL 1 (best)5.84□□□□□ -1.471e-9■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 TBCK-207ENST00000503516 601 ntTSL 35.48□□□□□ -1.532e-6■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.531e-9■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 ATG7-206ENST00000423116 589 ntTSL 45.35□□□□□ -1.552e-6■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 ATG7-211ENST00000444619 565 ntTSL 45.32□□□□□ -1.562e-6■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.24□□□□□ -1.572e-6■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 RPL7L1-206ENST00000487619 490 ntTSL 45.22□□□□□ -1.572e-6■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.367e-16■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.87■■□□□ 1.413e-7■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 EP400NL-201ENST00000332441 2741 ntTSL 221.21■□□□□ 0.993e-7■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 EP400NL-209ENST00000488030 1366 ntTSL 220.29■□□□□ 0.843e-7■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 IDUA-202ENST00000502829 558 ntTSL 231.92■■■□□ 2.77e-22■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 GCAT-203ENST00000415371 552 ntTSL 425.1■■□□□ 1.614e-8■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 GCAT-204ENST00000426858 558 ntTSL 420.17■□□□□ 0.824e-8■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.664e-8■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.624e-8■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 GCAT-206ENST00000451984 716 ntTSL 315.55■□□□□ 0.084e-8■■■■□ 23
BUD13Q9BRD0 GTPBP3-226ENST00000601983 541 ntTSL 421.15■□□□□ 0.983e-11■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 GRAMD1A-206ENST00000598073 582 ntTSL 312.89□□□□□ -0.352e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.844e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 CBFA2T2-205ENST00000375279 7617 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.464e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 CBFA2T2-206ENST00000397800 7449 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.754e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 CBFA2T2-203ENST00000346541 7737 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.814e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 CBFA2T2-204ENST00000359606 7274 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.894e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 CBFA2T2-209ENST00000492345 7803 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.984e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 SAFB-213ENST00000592555 1360 ntTSL 520.05■□□□□ 0.81e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 GYS1-203ENST00000457974 718 ntTSL 318.51■□□□□ 0.557e-10■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 SAFB-210ENST00000591991 3471 ntTSL 212.9□□□□□ -0.341e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.111e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 ZMYND19-202ENST00000471957 1259 ntTSL 218.63■□□□□ 0.571e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.315e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 CASP2-202ENST00000350623 1146 ntTSL 1 (best)16.11■□□□□ 0.175e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.155e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 CASP2-206ENST00000493642 2166 ntTSL 1 (best)11.24□□□□□ -0.615e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 CASP2-204ENST00000472067 5769 ntTSL 210.37□□□□□ -0.755e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 NDRG1-220ENST00000521664 594 ntTSL 219.74■□□□□ 0.756e-25■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 PLXNA1-202ENST00000503234 4446 ntTSL 215.37■□□□□ 0.052e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 11e-6■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 MLH1-214ENST00000457004 668 ntTSL 316.22■□□□□ 0.191e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 MLH1-208ENST00000442249 558 ntTSL 416.22■□□□□ 0.191e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 MLH1-211ENST00000454028 570 ntTSL 513.71□□□□□ -0.211e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 MLH1-205ENST00000432299 928 ntTSL 1 (best)13.5□□□□□ -0.251e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 MLH1-220ENST00000492474 589 ntTSL 59.88□□□□□ -0.831e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 MLH1-204ENST00000429117 562 ntTSL 49.48□□□□□ -0.891e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 MLH1-219ENST00000485889 566 ntTSL 56.88□□□□□ -1.311e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 MLH1-217ENST00000466900 555 ntTSL 44.79□□□□□ -1.641e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.61e-18■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 TFRC-201ENST00000360110 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.841e-18■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 TFRC-203ENST00000420415 4814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -11e-18■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.574e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 TIMM50-216ENST00000601358 1481 ntTSL 1 (best)24.37■■□□□ 1.494e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.334e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.664e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.554e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 MICAL3-215ENST00000578984 569 ntTSL 318.83■□□□□ 0.61e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 CWF19L2-202ENST00000431778 2955 ntTSL 1 (best)6.89□□□□□ -1.311e-6■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.351e-6■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 CWF19L2-204ENST00000532251 2383 ntTSL 1 (best)3.73□□□□□ -1.811e-6■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 FBXW5-207ENST00000487794 1932 ntTSL 1 (best)22.46■■□□□ 1.191e-7■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 C10orf10-203ENST00000496638 868 ntTSL 324.28■■□□□ 1.483e-16■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.543e-16■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 C10orf10-202ENST00000448778 613 ntTSL 316.69■□□□□ 0.263e-16■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 KMT5A-208ENST00000485469 454 ntTSL 35.05□□□□□ -1.61e-9■■■■□ 22.9
BUD13Q9BRD0 TSEN54-207ENST00000580013 568 ntTSL 424.11■■□□□ 1.452e-6■■■■□ 22.8
BUD13Q9BRD0 ENO1-202ENST00000464920 2266 ntTSL 1 (best)13.91□□□□□ -0.183e-30■■■■□ 22.8
BUD13Q9BRD0 GTPBP3-223ENST00000600995 812 ntTSL 222.97■■□□□ 1.276e-10■■■■□ 22.8
BUD13Q9BRD0 GTPBP3-225ENST00000601261 606 ntTSL 421.15■□□□□ 0.986e-10■■■■□ 22.8
BUD13Q9BRD0 GTPBP3-228ENST00000602165 617 ntTSL 421.11■□□□□ 0.976e-10■■■■□ 22.8
BUD13Q9BRD0 GTPBP3-206ENST00000594345 1004 ntTSL 320.75■□□□□ 0.916e-10■■■■□ 22.8
BUD13Q9BRD0 GTPBP3-224ENST00000601213 584 ntTSL 420.21■□□□□ 0.836e-10■■■■□ 22.8
BUD13Q9BRD0 GTPBP3-215ENST00000596941 678 ntTSL 220.21■□□□□ 0.836e-10■■■■□ 22.8
BUD13Q9BRD0 GTPBP3-204ENST00000593297 555 ntTSL 420.12■□□□□ 0.816e-10■■■■□ 22.8
BUD13Q9BRD0 NCAPD3-207ENST00000528065 557 ntTSL 45.01□□□□□ -1.611e-6■■■■□ 22.8
Retrieved 100 of 53,381 protein–RNA pairs in 1491.4 ms