Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK0

CIC, Protein capicua homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CICQ96RK0 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CICQ96RK0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CICQ96RK0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms