Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
LMTK3Q96Q04 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
LMTK3Q96Q04 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms