Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NLRP3Q96P20 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NLRP3Q96P20 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms