Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
PRAC1Q96KF2 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms