Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC34Q96HJ3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCDC34Q96HJ3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms