Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDI1

EHBP1, EH domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHBP1Q8NDI1 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
EHBP1Q8NDI1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms