Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
NPAS3Q8IXF0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NPAS3Q8IXF0 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms