Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SV2AQ7L0J3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SV2AQ7L0J3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms