Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
USP31Q70CQ4 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC27.56■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.55■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.54■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC27.54■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.53■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC27.53■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.53■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC27.52■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.52■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.52■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
USP31Q70CQ4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
USP31Q70CQ4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms