Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
FAM47EQ6ZV65 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms