Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP47Q6ZTR5 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP47Q6ZTR5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP47Q6ZTR5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP47Q6ZTR5 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP47Q6ZTR5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CFAP47Q6ZTR5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CFAP47Q6ZTR5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms