Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CAPN12Q6ZSI9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CAPN12Q6ZSI9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms