Protein–RNA interactions for Protein: Q6W349

LINC00575, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00575, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00575Q6W349 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
LINC00575Q6W349 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
LINC00575Q6W349 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
LINC00575Q6W349 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00575Q6W349 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00575Q6W349 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00575Q6W349 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00575Q6W349 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00575Q6W349 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00575Q6W349 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00575Q6W349 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00575Q6W349 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00575Q6W349 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00575Q6W349 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00575Q6W349 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00575Q6W349 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00575Q6W349 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00575Q6W349 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00575Q6W349 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00575Q6W349 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
LINC00575Q6W349 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms