Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CASP12Q6UXS9 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CASP12Q6UXS9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms