Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWI4

SHISA2, Protein shisa-2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA2Q6UWI4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SHISA2Q6UWI4 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SHISA2Q6UWI4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms