Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SMARCD3Q6STE5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms