Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CAVIN1Q6NZI2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CAVIN1Q6NZI2 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms