Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GDF6Q6KF10 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GDF6Q6KF10 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.8 ms