Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TMEM78Q5T7P6 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms