Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ATAD3CQ5T2N8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ATAD3CQ5T2N8 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms