Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ANKRD39Q53RE8 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ANKRD39Q53RE8 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms