Protein–RNA interactions for Protein: Q2WEN9

CEACAM16, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 16, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM16Q2WEN9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CEACAM16Q2WEN9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms