Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
MSMPQ1L6U9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms