Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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